数字PCR之俗解

发表时间:2018-10-23 00:00作者:病理柳叶刀

随着精准医疗的高速发展,各项平台及检测技术也在日新月异,可谓是百家争鸣,百花齐放。今天笔者参加了一个3D数字PCR的专项讲座,正好借此机会和大家来聊聊Digital  PCR到底有着怎么样的魅力。

实际上数字PCR也算不上新技术,早在2003年的时候Dressman等发明了BEAMing技术,至此之后,数字PCR便慢慢出现在人们面前。可是为什么这么一个很先进的技术直到现在才开始被大家重视起来呢?难道数字PCR技术真的只是“花拳绣腿”?可能到现在还是有很多科研工作者对该技术也只是道听途说,其真正原理并不清楚,这里我就通俗的简而概之:就是将一个pcr管里的反应体系平均的分布为成千上万个小体系,保证每个小体系中只有一个拷贝,如果反应就会发出一个荧光信号,在通过信号采集读出信号量。如此看来它还是普通PCR反应,只是在灵敏度和精确性上有了巨大的提升。

说到这里大家可能会想到,如何才能保证每个小体系中只有一个拷贝呢,目前市面上只有三种方式,即涂抹式,雾化式和微滴式,实战中三者总体的分布效果还是不错的,当然后者效果更佳。有意思的是这种PCR技术突破了传统的八联管和96孔板等,以芯片为体系载体成为了主要趋势。

目前数字PCR技术产品主要有以下四类:ABI3D数字PCR系统,伯乐微滴式数字PCR系统,Raindance数字PCR系统。具体信息和区别,网上很多也很方便查到。

那么很重要的一点,它究竟有什么用途呢?这里笔者认为,技术是死的,但人的想象力是丰富的,只要愿意去思考探索,它必定会有无限的可能!这里我简单列举一下当前应用广泛的领域:

1,微小突变

2,癌症标志物检测        

3,无创产前检查

4,CNV微小差异检测

5,病原微生物检测

6,microRNA研究

7,NGS测序文库的绝对定量

8,表观遗传学直接相关的DNA甲基化定量检测

9,ChIP定量鉴定等领域

与传统qPCR技术相比,数字PCR技术具有极高的灵敏度、特异性和精确性,但截止目前而言,数字PCR对广大科研工作者仍然是一种全新的检测方法,我们在看待数字PCR的应用前景时,更应该保持一种开放的心态,与其说数字PCR技术是一个新的检测平台,不如把它视为一种全新的技术思路和手段,在这个平台上必将有更多的应用帮助我们深入到分子生物学研究的更高层次。

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